Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TAF1P21675 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TAF1P21675 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TAF1P21675 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TAF1P21675 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms