Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ERCC3P19447 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ERCC3P19447 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms