Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FLT1P17948 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FLT1P17948 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FLT1P17948 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FLT1P17948 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms