Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTLA4P16410 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CTLA4P16410 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms