Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GTF2F2P13984 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms