Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
COL6A2P12110 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
COL6A2P12110 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms