Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
C4AP0C0L4 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C4AP0C0L4 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms