Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VIL1P09327 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VIL1P09327 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VIL1P09327 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VIL1P09327 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms