Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HSP90AB1P08238 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms