Protein–RNA interactions for Protein: P02652

APOA2, Apolipoprotein A-II, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA2P02652 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
APOA2P02652 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
APOA2P02652 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
APOA2P02652 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms