Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MAP4K4O95819 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MAP4K4O95819 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms