Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DDX58O95786 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DDX58O95786 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms