Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLR1AO95602 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLR1AO95602 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms