Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP19O94966 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP19O94966 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
USP19O94966 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
USP19O94966 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
USP19O94966 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
USP19O94966 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
USP19O94966 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
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