Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBXN7O94888 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms