Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFL1O94874 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UFL1O94874 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFL1O94874 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFL1O94874 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFL1O94874 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFL1O94874 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFL1O94874 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms