Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
TRPM2O94759 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRPM2O94759 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms