Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BBOX1O75936 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BBOX1O75936 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms