Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KDM4AO75164 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KDM4AO75164 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms