Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMARCA5O60264 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms