Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BNIP3LO60238 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
BNIP3LO60238 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms