Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DHX16O60231 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX16O60231 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX16O60231 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms