Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALUO43852 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALUO43852 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALUO43852 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALUO43852 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CALUO43852 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CALUO43852 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CALUO43852 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CALUO43852 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CALUO43852 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms