Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SYNGR3O43761 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms