Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1GO43497 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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