Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HTRA2O43464 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms