Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
POLR1CO15160 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR1CO15160 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms