Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SETD1AO15047 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms