Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SEMA3EO15041 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SEMA3EO15041 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms