Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F3O00716 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms