Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
EBAG9O00559 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
EBAG9O00559 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms