Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
J3KR12 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
J3KR12 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
J3KR12 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
J3KR12 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms