Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C1D1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C1D1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C1D1 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C1D1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C1D1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C1D1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C1D1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C1D1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms