Protein–RNA interactions for Protein: H3BNL8

C6orf229, Uncharacterized protein C6orf229, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf229H3BNL8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C6orf229H3BNL8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C6orf229H3BNL8 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms