Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
C9orf172C9J069 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms