Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
STRCP1A6NGW2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCP1A6NGW2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms