Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM247A6NEH6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TMEM247A6NEH6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms