Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EFCAB5A4FU69 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EFCAB5A4FU69 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms