Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LAMB4A4D0S4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LAMB4A4D0S4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms