Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRAMEF22A3QJZ6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms