Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GTF3C3Q9Y5Q9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms