Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD2APQ9Y5K6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD2APQ9Y5K6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms