Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
AFG3L2Q9Y4W6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms