Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSX2IPQ9Y2D8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX2IPQ9Y2D8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX2IPQ9Y2D8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSX2IPQ9Y2D8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms