Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVW-1Q9UQF0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVW-1Q9UQF0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms