Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SHANK2Q9UPX8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms