Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAK1Q9UPV9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAK1Q9UPV9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms