Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDZRN3Q9UPQ7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms