Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SSR3Q9UNL2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms