Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP3Q9UKI2 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms